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常见问题

微生物的菌种鉴定可以鉴定到“株”一级吗?

如果你的菌株是自然界中分离得到,就只能鉴定到种,不能鉴定到株,因为多多少少和其他株系的细菌有区别,即便你做了一些特征的鉴定,发现和某一株细菌一模一样,你也没有理由说你的细菌就是那一株细菌,因为你不可能把所有的特征都做完,株和株之间的关系就相......

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菌种鉴定的方法和步骤是什么?

菌种鉴定一般就只要提取基因组DNA,然后PCR扩增16srDNA片段,上GeneBank或者Eztaxon对比即可。一般序列相似度在97%以上就可以认为是同种细菌

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菌种鉴定可以鉴定到种吗?

利用rRNA的保守区域进行鉴定只是菌种鉴定的一个分子生物学指标,通过鉴定结果可以了解未知菌株和NCBI公布序列的哪个种属比较接近。如果鉴定至种,还需要DNA杂交、基因组GC含量、生理生化指标等来综合判断。

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峰图中断怎么处理

如下图,测序峰图到300多bp就中断了。原因:变性后的单链在该处很有可能互补或在全序列中有大的特殊结构,造成严重的二级结构,使dNTP和ddNTP不能和模板结合,测序酶无法正常延伸。解决方法:酶切,做亚克隆测序 

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测序结果出来双峰如何处理

测序过程中最常见的问题是双峰,导致整个结果不可用。明明挑的是单克隆,为什么还会碰到双峰呢?其实导致双峰的原因是多种的,双克隆只是其中的一原因,而且不同的起因在峰图上表现出不同的特征,通过对峰图的分析找出双峰的起因是解决问题最直接的方法。双克......

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碱基缺失导致峰图混乱

碱基缺失其实是双模板的一种特殊形态,指某一样品在某一碱基后包含两类片段,其中一条片段比另一条片段少(或多)几bp或几十bp,因此在峰图上表现为从某处开始为两个峰的叠加,碱基缺失多发生在PCR测序中,并在峰图上表现出一定的规律。一个模板比另一......

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poly结构导致移码

PolyA/T结构通常致其后的峰图出现重叠峰,PolyG/C 结构通常致其后的峰图出现信号衰减。Poly结构是导致测序失败最常见的原因之一,目前还没有非常有效的方法彻底解决Poly结构的影响,但一般而言,PCR样品Poly结构后双峰的概率非......

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