线粒体是真核细胞内的一种十分重要的细胞器,是细胞进行氧化磷酸化的场所。线粒体拥有自身的DNA和遗传体系,与生物进化与及细胞起源有很密切关系。线粒体全基因组在生物进化的研究中也具有独特的优势。由于线粒体有着与真核生物长期共生的进化历史,因此其基因组包含了反映物种进化的关键信息,同时,相对于核基因组,线粒体基因组小,容易对大量物种进行横向的比较分析,有利于生物进化的研究,因而受到进化生物学家的钟爱。
线粒体有典型两大特点:(1)进化快、丰度高,遗传模式简单(2)线粒体基因组也具有保守紧凑的结构特点,如细胞色素C氧化酶I亚基COI基因)
除了少数低等真核生物的线粒体基因组是线状DNA分子外,一般都是一个环状DNA分子。由于线粒体DNA并不容易从细胞中分离出来进行直接测序分析。通过对总DNA进线粒体长距离PCR调取、进行简单鸟枪库构建,或者通过染色体步移等方法对已知片段两侧未知序列的获取成为了获得线粒体基因组全序列最有效的方法。
本公司长期从事线粒体基因组全长测序,通过在各种藻类、软体动物、节肢动物,各种海洋生物如鱼类、蚌类等、各种鸟类、蝙蝠等脊椎动物中积累了解决线粒体调取中遇到的各种难题,如基因重排,重复序列、高GC等结构,通过我们的技术专长和对线粒体基因组序列特性的长期把握,并且结合公司的鸟枪库构建平台和独特的自行开发的染色体步移试剂盒,将以最快的速度和最保真的效率为你获得想要的全长序列。
(1)物种的分类和鉴定。
(2)动物种群遗传和分子系统发育研究
(3)线粒体DNA序列变异用作种群遗传学和种系发生研究的标记。
(4)地理群体的遗传变异分析等
(1)所需要研究物种的-80度组织材料>300mg或者提取好的基因组DNA(总量100ul,浓度>100ng/ul;)
(2)该物种的相关资料与文献、种属信息等
(1)根据相关物种或者已知的保守序列,设计引物,PCR钓取序列信息;
(2)鸟枪库构建
(3)根据已知的序列信息设计多对引物,利用染色体步移技术,对已知片断两侧序列进行获取;
(4)完成序列拼接
(5)做基础注释。
(1)测序原始峰图文件(.seq、.ab1)序列
(2)实验相关流程和电泳文件
(3)全长拼接序列
(4)注释好的线粒体全基因组序列