迈浦生物

BAC文库构建及基因筛选

BAC文库构建及基因筛选

BAC文库构建简介

上海迈浦生物科技有限公司有丰富的BAC文库构建的经验,构建过包括脊椎/无脊椎动物、微生物在内的大量BAC文库。

应用领域

(1)全基因组测序;

(2)构建物理图谱;

(3)染色体步查;

(4)基因筛选;

(5)基因图位克隆等。

我们的优势

(1)5倍的基因组大小的容量的覆盖率,其中保证了99.3%的发现目标序列的概率。

(2)120kb的平均插入片段。如果插入的片段小于120kb,我们会增加克隆的数量。

(3)酶切过程中,用人的基因组做为内参进行质控

(4)有着构建植物、真菌、细菌和动物文库的经验和处理高GC含量的生物和海洋细菌的经验

(5)阵列BAC文库是用带条形码的微孔板来运输。

(6)项目开始就提供技术支持。

(7)BAC文库是客户的财产,绝对不会在内部使用,出售或者分发。

(8)服务对象遍布全球的著名大学、科研机构和高技术公司。

提供材料具体要求

动物、植物、微生物组织,请提供足量的新鲜样品(4℃保存,不超过一天)或保存于液氮或-80℃的新鲜样品。 具体数量根据您所建文库的生物的基因组大小而定。

注意: 用植物样品构建基因组文库时,为了降低文库中的叶绿体DNA污染,样品须是植物的黄化苗嫩芽。

纯化后DNA请提供:(1) 高纯度且具有较好完整性(>1Mb)的样品DNA,浓度>20ng/ul,最小量>20ug,OD 260 /OD 280值:1.75~1.85,请附上样品的原电泳胶图;定量以我公司电泳胶图、紫外分析仪定量为准。DNA 的总量根据库容量不同会有所增加。(2) 高质量的DNA plug胶块。注意:样品DNA或DNA的plug胶块均可,二者选其中一种。为了更好的保持DNA的状态,防止样品的降解,样品在运输时必须保持低温状态,但不可冷冻。

技术服务流程:

BAC建库流程

我们提供的服务内容:

(1)本公司已以解决了海关运输困难问题,将在保证质量的前提下,在最短的时间内完成实验。时间不会多于国内同行业公司

(2)阵列BAC文库(包括挑克隆),阵列克隆并且在384孔板里扩增(1个单一克隆/孔),并且用干冰运输。微孔板用条形码标签区分。

(3)未阵列的BAC文库(不包括挑克隆),贮存在甘油里,用干冰运输的未扩增的BAC克隆混合物(转化后的含有BAC DNA的E. coli 细胞)。免费多送5%的克隆以补偿运输过程中的滴度损失。这个选项推荐给那些研究大基因组和/或有能力做阵列和/或想要控制运输费用的科学家

近期建库平均长度

Starting material Insert size
Musmusculus 180 Kb
Zea mays 150 Kb
P. brassicacearum 160 Kb
P. omnivore 185 Kb
Arabidopsis thaliana 150 Kb
Homo sapiens 215 Kb

电泳图

Figure 1: PFG following NotI digestion of insect BAC clones ( Mamestra configurata ) with an average insert size of 178Kb
Figure 2: PFG following NotI digestion of fungal BAC clones P. omnivora) with an average insert size of 185Kb.

Graph 1: BAC clone insert size distribution (average of 140Kb) of a Soybean BAC library (Glycine max)

报价要求:报价之前,请发以下材料

(1)感兴趣的生物。

(2)起始材料类型(叶片、细胞、活检组织等)。

(3)起始材料有限吗?

(4) BAC文库的用途是什么(短期和长期如果适用)?

(5)知道或者可以预测目标物种的基因大小(单倍体)。

(6)预期的基因覆盖率。

发到迈浦生物BAC国际项目部负责人,刘女士 liufeng@mapbioo.com。或者Areti Karadimos女士, areti@biost.com。(请在邮件内容中注明邮件来自liufeng -MAP company-china)